Естественно-научное направление ориентировано на научную деятельность обучающихся, развитие наблюдательности и воображения, самостоятельность и творчество, приобщение к практической экологической работе.
Программы данного направления призваны дополнить и углубить школьные программы по экологии, биологии, химии и основываются на профильном уровне государственного образовательного стандарта, превышая его.
Реализация естественно-научного а так же и эколого-биологической обучения осуществляется посредством разнообразных методов, средств и форм, в том числе учебно — исследовательских экспедиций, походов, полевых практик, разработки проектов, проведения опытов и экспериментов.